In Madame Sidonie in Japan reist eine Autorin, Sidonie Perceval, ins Land der aufgehenden Sonne. Hier will sie 40 Jahre nach dem Erscheinen ihres ersten Buches die Neuauflage ihres einstigen Debüt-Romans promoten.

Sidonie Perceval, eine etablierte französische Schriftstellerin, trauert um ihren verstorbenen Mann. Als sie für die Neuauflage ihres ersten Buches nach Japan eingeladen wird, empfängt sie ihr dortiger Lektor und nimmt sie mit auf eine Reise, durch den japanischen Frühling, nach Kyoto, der Stadt der Schreine und Tempel. Doch der Geist ihres Mannes verfolgt Sidonie: Sie muss endlich die Vergangenheit loslassen, um wieder lieben zu können.